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Text File  |  1995-03-04  |  2.3 KB  |  51 lines
  1. ******************************************
  2. * Serine carboxypeptidases, active sites *
  3. ******************************************
  4.  
  5. All  known  carboxypeptidases  are either  metallo carboxypeptidases or serine
  6. carboxypeptidases  (EC 3.4.16.5  and  EC 3.14.16.6). The catalytic activity of
  7. the serine   carboxypeptidases,   like  that  of  the  trypsin  family  serine
  8. proteases, is  provided  by  a  charge relay system involving an aspartic acid
  9. residue hydrogen-bonded to a histidine, which is itself  hydrogen-bonded  to a
  10. serine [1]. Proteins known to be serine carboxypeptidases are:
  11.  
  12.  - Barley and wheat serine carboxypeptidases I, II, and III [2].
  13.  - Yeast carboxypeptidase Y (YSCY) (gene PRC1), a  vacuolar  protease involved
  14.    in degrading small peptides.
  15.  - Yeast  KEX1  protease,  involved in killer toxin and alpha-factor precursor
  16.    processing.
  17.  - Fission  yeast  sxa2,  a probable carboxypeptidase involved in degrading or
  18.    processing mating pheromones [3].
  19.  - Penicilium janthinellum carboxypetidase S1 [4].
  20.  - Vertebrate protective protein / cathepsin A [5], a  lysosomal protein which
  21.    is not only a carboxypeptidase but also  essential for the activity of both
  22.    beta-galactosidase and neuraminidase.
  23.  
  24. The sequences  surrounding  the  active site serine and histidine residues are
  25. highly conserved in all these serine carboxypeptidases.
  26.  
  27. -Consensus pattern: [LIVM]-x-[GT]-E-S-Y-[AG]-[GS]
  28.                     [S is the active site residue]
  29. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  30. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  31.  
  32. -Consensus pattern: [LIVM]-x-[GDN]-[AG]-[SG]-H-x-V-P
  33.                     [H is the active site residue]
  34. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  35.  sxa2.
  36. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  37.  
  38. -Last update: June 1994 / Patterns and text revised.
  39.  
  40. [ 1] Liao D.I., Remington S.J.
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  51.